CeTICS, Centro de Toxinas, Imuno-Resposta e Sinalização Celular

O CeTICS, Centro de Toxinas, Imuno-Resposta e Sinalização Celular, está selecionando candidatos para duas vagas de Pós-Doutorado com bolsa FAPESP no Instituto Butantan.

Vaga 1: Montagem, anotação e análise comparativa de genomas de serpentes Supervisor: Inácio Junqueira de Azevedo, Laboratório Especial de Toxinologia Aplicada O pós-doutorando deverá atuar na análise de dados gerados a partir de genomas e transcriptomas de serpentes brasileiras, visando otimizar as versões disponíveis, refinar as anotações, realizar comparações entre espécies e interpretar elementos chaves do genoma. Terá contato com a parte wet-lab do projeto, guiando eventuais experimentos de resequenciamento, mas focará sua atuação no dry-lab e na revisão bibliográfica, necessárias para o entendimento da evolução e diversificação do veneno ofídico e também para biologia geral das serpentes. Qualificações para vaga: (1) possuir título de doutor em área correlata ao projeto (pre-requisito); (2) ter comprovada experiência em projetos envolvendo genômica (pré-requisito); (3) ter domínio do uso de ferramentas bioinformáticas para análise de dados genômicos, preferencialmente montadores e alinhadores de genomas (pré-requisito); (4) possuir capacidade de programar e desenvolver ferramentas bioinformáticas (desejável); (5) ter conhecimentos acerca de venenos e toxinas animais e/ou evolução de famílias gênicas (desejável).

Vaga 2: Mecanismos de ação de venenos animais Supervisor: Denise Tambourgi, Laboratório de Imunquímica O pós-doutorando deverá estudar os mecanismos envolvidos nos envenenamentos por animais venenosos. Estamos atualmente à procura de um doutor na área de Bioquímica. Os candidatos devem ter ótima habilidade de escrita e de comunicação em Inglês e estar familiarizados com técnicas envolvidas nos estudos de interactoma de receptores e proteômica, bem como em interações biomoleculares, usando ressonância plasmônica. Buscamos indivíduos altamente motivados e colaborativos capazes de raciocínio independente e entusiasmados com o aprendizado de novas tecnologias. A entrega de dados experimentais dentro de um determinado período e a gestão eficaz do tempo são extremamente importantes no nosso processo de trabalho de laboratório. Os interessados em qualquer das vagas devem enviar e-mail para cetics.gestao@butantan.gov.br até 20/05/2017, contendo: – CV (preferencialmente no formato Lattes); – carta de interesse e apresentação; – carta de recomendação Após uma pré-seleção, poderá ser marcada uma entrevista pessoalmente ou por Skype. Obs: A bolsa terá duração de um ano, valor de R$ 6.819,30, e conta com reserva técnica (15% do valor anual da mensalidade). Consulte http://www.fapesp.br/en/5427

Ph.D. and/or Postdoctoral Position NMR and Biophysical Studies of FtsZ Gueiros-Filho Lab – Biochemistry, USP - Brazil

FtsZ, the prokaryotic homologue of tubulin, is the universal driver of bacterial cell division and an attractive target for new antibiotics. Our group has been using a combination of approaches (genetics, live cell microscopy and structural biology) to study the mechanism of FtsZ polymerization and how it is regulated by modulator proteins. More recently, we established the conditions for applying NMR to FtsZ. This breakthrough should allow addressing several questions that have not been accessible by X-ray crystallography, such as: 1) Determination of the allosteric mechanism of polymerization; 2) Mapping of the interaction with modulators that do not co-crystalize with FtsZ; 3) Screening and mapping binding sites of candidate small molecule inhibitors. We are seeking highly motivated candidates, capable or working independently and interested in bridging basic science with antibiotic discovery. Previous experience with protein NMR is highly desirable, but not mandatory.

Applicants should send their CV and a brief description of their past research experience to Frederico Gueiros-Filho (fgueiros@iq.usp.br) and should organize 2 recommendation letters to be sent directly to the same email address. University of São Paulo (USP) is the #1 university in Latin America and is consistently ranked among the top 100 universities of the world (https://www.timeshighereducation.com/world-university-rankings/university-of-sao-paulo#ranking-dataset/558261).

The Department of Biochemistry is one of the leading research centers in Brazil, with an internationally recognized faculty and world class facilities, including an 800 MHz NMR spectrometer. This project involves collaboration with the group of Dr. Jose Manuel Andreu, CIB, Madrid, and may include visits to his group.

References: Bisson-Filho et al., (2015). PNAS 112:E2130-E2138. Blasios et al., (2013). PLoS One, 8:e60690. Castellen et al., (2015). Biomolecular NMR Assignments 9:1-5. Nogueira et al., (2015). Biomolecular NMR Assignments 9:387-91. Publicado em 27 de março de 2017

Post Doctoral Position - IQ-USP

Post Doctoral Position Department of biochemistry – University of São Paulo The Institute of Chemistry of the University of São Paulo invites applicants for one post- doctoral position, for the Department of Biochemistry at the Institute of Chemistry under the Supervision of Dr. Glaucia Mendes Souza. The Institute of Chemistry is one of the top life sciences research centers in Latin America, with state-of-the-art facilities for genomic, cell, structural biology and analytical chemistry, among others (http://www.iq.usp.br). It has an internationally recognized faculty and a talented pool of graduate students and postdoctoral fellows. We seek individuals who are highly qualified and capable to develop competitive research at the cutting edge of Sugarcane Genomics and Bioinformatics, to contribute to the Systems Biology of sugarcane, analyzes results of genome sequence, transcriptome and metabolome. One of the tools developed by the laboratory is a web application (http: // sucest- fun.org/wsapp) for access and analysis of data from SUCEST-FUN DB bank. This tool has the font-end developed in Java and various scripts developed in Perl and R languages. Data analysis and integration of results in the database uses SQL. Familiarity with these languages is a plus and also experience with genome and RNA-Seq (RNA sequencing) analysis and statistical analysis of data. Applicants for the position should hold a PhD degree. If selected the candidate will hold a Post-Doctoral Fellowship from FAPESP (http://www.fapesp.br/en/5427) with a monthly stipend of R$ 6.819,30 for two years (renewable for up to 4 years). Applicants should send a Full CV with photo, Complete School Record, 2 references and letter describing your interests and previous experience. Additional information can be obtained by direct inquiry to glmsouza@iq.usp.br.

Instituto de Física de São Carlos – Universidade de São Paulo

Oportunidade de Bolsa de Pós-doutorado Centro de Pesquisa e Inovação em Biodiversidade e Fármacos – CIBFar/CEPID/FAPESP Instituto de Física de São Carlos – Universidade de São Paulo

Projeto: “Caracterização estrutural das proteínas do vírus Zika e a busca por agentes antivirais”

Supervisor: Dr. Glaucius Oliva

Resumo: A febre zika, causada pelo zika vírus (ZIKV), é uma doença emergente que em 2016 atingiu todos os continentes do globo, alcançando o estado de pandemia. Além dos sintomas similares aos da dengue, a infecção pelo ZIKV também pode causar a má formação em fetos e problemas neurológicos em adultos, como a síndrome de Guillain-Barré. Apesar dos esforços mundiais, os mecanismos de transmissão, replicação, evasão do sistema imunológico e efeitos deletérios do ZIKV não são bem compreendidos. Até o momento não existem tratamentos ou formas eficientes de erradicação do vírus, sendo que a prevenção e controle das populações de mosquito transmissor são as únicas formas de combate ao ZIKV. O ZIKV é um retrovírus de cadeia positiva, onde o material genético codifica uma poliproteína que forma dez proteínas maduras. Destas, duas formam o envelope viral, uma o capsídeo, e outras sete estão envolvidas no processo de replicação do vírus. As proteínas de envelope, e as proteínas NS1 e NS3 já tiveram partes de suas estruturas cristalográficas resolvidas. Nossa proposta é estudar prioritariamente as proteínas cujas estruturas não estão disponíveis utilizando técnicas de biologia molecular e cristalografia de raio-X, a fim de determinar as estruturas tridimensionais das mesmas. Vamos também buscar expressar e cristalizar as proteínas já relatadas na literatura, pois o interesse maior do nosso grupo é a busca por ligantes candidatos a fármacos antivirais, usando a metodologia do Planejamento de Ligantes Baseado na Estrutura do Receptor. Esse projeto está vinculado ao projeto CEPID CIBFar da FAPESP, e tem também como objetivo estabelecer uma base no grupo para estudos de vírus. Os candidatos devem ter título de Doutor e experiência com técnicas de biologia molecular (cultura celular, clonagem e subclonagem, transecção e ensaios celulares) e cristalografia de proteínas.

Os interessados devem enviar curriculum vitae, carta de interesse e duas cartas de recomendação para o professor Glaucius Oliva no endereço oliva@ifsc.usp.br.

O selecionado receberá bolsa de Pós-Doutorado da FAPESP no valor de R$ 6.819,30 mensais e Reserva Técnica. A Reserva Técnica da bolsa de PD equivale a 15% do valor anual da bolsa e tem o objetivo de atender a despesas imprevistas e diretamente relacionadas à atividade de pesquisa. Caso o bolsista resida em domicílio diferente e precise se mudar para a cidade onde se localiza a instituição sede da pesquisa, poderá ter direito a um Auxílio-Instalação.

Unicamp, IQM

POSTDOCTORAL POSITION IN BIOCHEMISTRY, BRAZIL Applications are invited for postdoctoral research to study the relationship between structure and function of specific molecular chaperones with emphasis in protein-protein and protein-ligand interactions. The goal is to build models to explain the mechanism by which molecular chaperones interact with unfolded substrates and transfer them to specified molecular machines. Our group seeks also to identify potential targets for therapeutic intervention. The successful candidate will have a relevant PhD in Biochemistry or correlated areas and will have experience in the techniques involved, including molecular biology, protein purification, molecular biophysics, structural biology and protein-protein interaction. Evidence of practical work experience in yeast genetics (complementation) or structural protein crystallography would be an advantage. Period: up to four years depending on performance. Expected beginning in July 2016. Benefits: FAPESP fellowship (monthly stipend of R$ 6.819,30; expenditure on transport; aid installation; and research contingency funds). Main obligations: The candidate should have concluded a doctorate less than seven years before the beginning of the PD fellowship; The fellowship demands full time dedication to the research project; The fellowship holder may not hold any formal or informal employment nor receive, during the term of the fellowship.

More information: http://www.fapesp.br/en/5427 Applications with letter of interest, CV and name of three references should be sent to Carlos Ramos at cramos@iqm.unicamp.br

 

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